В 1893 году Савенков был переведен из Сибири по служебным делам в Польшу. В Варшаве Иван Тимофеевич работал инспектором народных училищ, принимал активное участие в работе общества естествоиспытателей при Варшавском университете, проводил археологические раскопки в окрестностях Варшавы и занимался разработкой теоретических вопросов педагогики.
Императорский Варшавский университет
Среди трудов Общества естествоиспытателей называется работа И. Т. Савенкова «К вопросу о быте постплиценового человека на Енисее». Кроме этого, в числе сообщений, сделанных в обществе с 1889 по 1899 годы, имеются упоминания о двух работах, принадлежащих И. Т. Савенкову «О следах каменного века на р. Сухоне» и «О памятниках, оставленных на Енисее человеком — современником мамонта». Признанием научных достижений исследователя в Варшаве стало его избрание действительным членом общества естествоиспытателей (отделения биологии).
“
«Между нами говоря, я здесь очень скучаю. Ради детей только я изъял себя из научного обращения, надеюсь временно, срок близок и я начинаю мечтать о том научном районе, где мне удалось кое-что сделать, точнее начать. Без Енисея я как рыба без воды. Его немного суровая, но для натуралиста глубоко привлекательная природа влечет меня назад. Такого интересного района для научной деятельности, соответствующей моим силам и моему скромному научному вооружению, я нигде не найду. Старый друг, Енисей, много лучше нового друга, Немана и Вислы»
Из письма барону Ж. де Баю из Варшавы в марте 1896 г.
Семья Савенковых и Шепетковские в Варшаве. 1900 г.
“
«Вы не можете себе представить, как тяжело мне живется на Висле среди чужих людей, среди бесцветной и несимпатичной природы, тому кто лучшие свои годы прожил на Енисее. Природы я лишен, для людей я совсем чужой. Я стою здесь на каторжной работе, непосильной для одного человека… Слишком многое противоречит моим служебным убеждениям, некоторые явления в служебной практике возмущают душу, расстраивают нервы. Я не карьерист и не какие чиновничьи соблазны не подавят во мне некоторых убеждений и взглядов, а главное никогда не погасят во мне маленькой научной и философской искорки. Как ни мал научный огонек, но мне только около него и тепло, только около него я нахожу душевное успокоение. Я здесь лишен общения с природою, служба берет все время, все силы и убивает этим научную энергию… Это лишение для меня самое тяжелое и непереносимое. Я мечтаю о возвращении в Сибирь. Теки здесь реки с молоком и медом, а меня все тянуло бы на Енисей: сжился я с ним, с его природою, сего людьми. Мне хочется продолжить собирание антропологических, геологических и географических материалов, — я прервал это собирание вопреки моему желанию»
Из письма Д. Н. Анучину из Варшавы в апреле 1896 г.
В 1896 году в Московском археологическом обществе вышла в свет книга «Каменный век в Минусинском крае».
В 1900 году И.Т. издал в Варшаве дидактический сборник «Учитель русской народной школы и его обязанности». Наставления учителям дополнили мысли и статьи различных педагогов, философов, писателей, ученых.
Савенков И.Т. Учитель русской народной школы и его обязанности